Está dividida en dos partes por el río Caiguanabo o río San Diego, al oeste se levanta la Sierra de los Órganos y al este, la Sierra del Rosario. Cada uno de estos territorios muestra un paisaje con características diferentes en cuanto al relieve, suelo, vegetación e hidrología.
En las elevaciones de los órganos predominan lomas, aisladas o en conjuntos, denominadas mogotes, en las cuales se distinguen numerosas cuevas o cavernas formadas por la acción de los ríos y las aguas subterráneas. Al norte y al sur a la Sierra de los Órganos se encuentran las Alturas de Pizarras, de donde nacen la mayor parte de los cruces de agua que perforan o serpentean entre los mogotes. Entre la mogotería caliza y las elevaciones de rocas de pizarras y arcilla, se encuentran preciosos valles como los de Viñales e Isabel María. El Mogote de la Virgen es su punto culminante erigiéndose con 591 metros sobre el nivel del mar.
encontrándose localizado en ella el Pan de Guajaibón con 699 metros sobre el nivel del mar, su punto culminante.
Principales cumbres de la Cordillera de Guaniguanico
